小引卷之一医学源流第一中风第二虚痨第三咳嗽第四疟疾第五痢症第六心腹痛胸痹第七隔食反胃第八气喘第九血症第十水肿第十一卷之二胀满蛊胀第十二(水肿参看)暑症第十三泄泻第十四眩晕第十五呕哕吐第十六(呃逆附)癫
环周图说难上卷本输穴说难手太阴肺经五穴一、少商（井穴）二、鱼际（荥穴）三、大渊（俞穴）四、经渠（经穴）五、尺泽（合穴）手阳明大肠经六穴一、商阳（井穴）二、二间（荥穴）三、三间（俞穴）四、合谷（原穴）五
铜人针灸经点校说明卷一卷二卷三卷四卷五卷六卷七
绪 言第一章 经络总论一、经络的组成和作用二、经络的标本、根结、气街、四海三、经络的生理功能和临床应用第二章 腧穴总论一、腧穴的发展、分类和命名二、腧穴的作用三、特定穴的意义和特点四、腧穴的定位第三章
卷一明目赋（一）眼科论孙真人谕眼论阴阳相应辨论上古天真论眼科通明论轩辕黄帝说眼病目科四季五行发挥妙诀明目赋（二）太玄真人论眼病五轮所属太玄真人问眼病因论八廓所属八卦也论五轮受病之因论八廓受实热病之因论
脉诀阐微
灵枢经
第1部分第2部分第3部分
序自序卷一卷二卷三卷四
序自叙卷一朝廷对于医者之医方卷二世界对于医者之医方卷三医者自医之医方