一、中风门二、风痹门三、心腹痛门四、霍乱门五、呕吐门六、气门七、痰饮门八、痨瘵门九、胁痛门十、腰痛门十一、香港脚门十二、积聚门十三、脾胃门十四、补益门（一）导引行气法（二）虾蟆行气法（三）入火法（四）
中风肝气眩晕头风虚劳咳嗽吐血失音肺痿遗精小便不通小便不禁汗脱脾胃木乘土肿胀积聚痞噎膈反胃关格嗳气呕吐吐蛔肠痹便秘肺痹胸痹哮喘呃逆黄胆风寒中寒风温温热冬温伏邪暑湿燥疫疹痰痰饮郁肝火不寐嘈杂三消脾痹疟泄泻
养生类要
医学发明
普济本事方序卷第一中风肝胆筋骨诸风真珠丸独活汤星附散二生散救急稀涎散胜金丸拒风丹苏合香丸灸中风十二穴续断汤山蓣丸独活散地黄酒防风汤竹沥汤防己汤木瓜煎养血地黄丸羚羊角汤乌头汤小续命汤排风汤小风引汤《千金
序一序二凡例卷之一伤寒伤寒论两感论附：嗣真少阴症似太阳太阳脉似少阴不同论太阳论阳明少阳论三阴论三焦论阴证论阴虚论内伤论表症论里症论热症论舌论附金镜录辨舌黑治法结胸论发狂谵语蓄血发发疹（附）发黄吐蛔厥症
普济本事方续集
第1部分第2部分第3部分
第1部分第2部分
序凡例卷上温病总论伤寒温病辨（四则）风温上焦篇风温中焦篇风温下焦篇卷下湿温上焦篇湿温中焦篇湿温下焦篇附温病治法要略附方