凡例正文经义脉要针灸歌诀手法总论摸法接法端法提法按摩法推拿法器具总论裹帘振梃披肩攀索迭砖通木腰柱竹帘杉篱抱膝接骨歌诀上歌诀方法总论内证出血泛注发热外邪昏愦眩晕烦躁发喘作呕口渴不食秘结瘀滞血虚作痛筋挛骨
序卷一十二官六脏六腑纳甲诗内景说心说肝说脾说肺说肾说胃说胆说大肠小肠说三焦说手心主说(即心包络)膀胱说命门说附录高士宗部位说经络易知十二经脉起止图十六络穴图经络说十二经诗十六络诗十二经气血流注诗（旧本
简介序上卷中卷下卷
自序集之一·初生门证治通论钱氏论五脏所主五脏病五脏相胜洁古论五脏五邪相乘补泻大法五脏补泻法察色听声脉法死证襁褓乳哺乳儿法乳令儿病证哺儿法断乳法杂将护法集之一·初生门初生拭口法浴儿法断脐法灸脐法裹脐法服
宣明方论
旅舍备要方
药性歌括四百味
卷上论疮肿诊候入式法论荣卫色脉参应之法论持手诀消息法论三部所主脏腑病证论脉证名状二十六种所主病证论三部脉所主证候论三部脉所主杂病法诀论诊候肺疽肺痿法论将护忌慎法论疮疽肿虚实法辨疮肿浅深法辨脓法辨疮疽疖
叙上卷一、太极图抄引二、太极图（图缺）三、太极图说四、不知《易》者不足以言太医论五、问三才所同者于人身何以见之六、命门图说（图缺）七、右肾水火辩九、《难经正义》三焦评附：东垣三焦论十、问诊三焦包络十一
序凡例卷上温病总论伤寒温病辨（四则）风温上焦篇风温中焦篇风温下焦篇卷下湿温上焦篇湿温中焦篇湿温下焦篇附温病治法要略附方