正文以上发明病根，是本段之前半截。下乃备引经义，以证其实而足其理。以上论理升降出入，是病机也。推病根，为第二段。以上推论化气，发明标本，是补足前半篇义理，为第三段。以下论五味补泻治法，退出通篇，为第四
卷一卷一伤寒传经从阳化热从阴化寒原委太阳风邪伤卫脉证太阳寒邪伤营脉证风寒营卫同病脉证误服三汤致变救逆三阳受病传经欲愈脉证阳明表病脉证阳明热病脉证阳明腑病脉证阳明慎汗慎清慎下少阳脉证少阳病用柴胡汤加减法
伤寒杂病论序伤寒论序自序后序卷首·仲景微旨 九章寒温异气传经大凡解期早晚寒热死生营卫殊病六经分篇六气司令一气独胜篇章次第卷一·脉法上篇 三十一章脉法上篇提纲脉法一脉法二脉法三脉法四脉法五脉法六脉法七脉
简介水·火·土·金·石部草部木部果·米谷·菜·人部兽·虫鱼部用药凡例煎药则例·服药序次·服药禁忌妊娠服禁·六陈·十八反当禁不禁犯禁必死·不必忌而忌之过
卷一 赋歌论诀秘旨保婴赋保生歌变蒸论察儿病症秘旨观形察色审病歌病源论（望闻问切）看食指定症诀（附）五指定症歌手探冷热定症诀视法视初生视周岁五视法面部察色秘旨探病秘旨推拿小儿总诀歌（附）观面部形色五脏秘
卷一中风总括中风死候类中风总括伤风总括痉病总括痉病死证破伤风痹病总括周痹痹病生死证痹入脏腑证痿病总括痿痹辨似痿病治法香港脚总括香港脚死证卷二内伤总括内伤外感辨似虚劳总括虚劳死证虚劳治法痨瘵总括痨瘵治法
叙卷一·琼瑶神书天部宋徽宗皇帝崇宁五年琼瑶真人一书手法序一琼瑶真人用升阳升阴气上气下之手法讲论歌二琼瑶标本运气歌三琼瑶辨十二经水火分治法四宋徽宗崇宁皇帝论五论手足阴阳流注篇六络脉传注周流不息七琼瑶真人
卷上勿药须知疗心法言林鉴堂安心诗养心说养肝说养脾说养肺说养肾说斋说食忌说食饮以宜居室安处论居处宜忌说寝室宜忌说卧时祝法睡诀孙真人卫生歌真西山卫生歌养神气铭孙真人养生铭谨疾箴导引却病法内养下手诀运气法固
藩署萧四爷治验丸方卫道观前头鸣右盛德清某嘉兴吴安徽程杭州汪嘉兴张薛家湾郭昆山陶绍兴邵西汇胡松江朱甘露华朱家角邵未录住址姓氏芦墟东茜墩陈又未录住址姓氏唯亭陆平望陆昆山陈梨里王常熟俞杭州钟徐若泉令亲姚名琨
卷一十二经循行部位歌头前正面歌头后项颈歌胸腹脊背图手膊臂外内歌足膝外内歌肺经歌大肠经歌胃经歌脾经歌心经歌小肠经歌膀胱经歌肾经歌心包络经歌三焦经歌胆经歌肝经歌任脉歌督脉歌脉诀十二经气血多少歌痈疽总论歌痈